Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrstQ06666 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrstQ06666 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrstQ06666 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrstQ06666 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrstQ06666 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrstQ06666 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrstQ06666 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms