Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
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Sh3bp2Q06649 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
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Sh3bp2Q06649 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms