Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atf4Q06507 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms