Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SPINDOCQ05AH6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms