Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms