Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rcn1Q05186 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms