Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms