Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox9Q04887 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox9Q04887 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox9Q04887 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox9Q04887 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox9Q04887 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox9Q04887 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox9Q04887 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox9Q04887 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox9Q04887 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox9Q04887 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox9Q04887 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox9Q04887 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox9Q04887 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox9Q04887 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox9Q04887 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox9Q04887 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox9Q04887 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox9Q04887 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox9Q04887 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox9Q04887 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox9Q04887 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sox9Q04887 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sox9Q04887 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sox9Q04887 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sox9Q04887 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sox9Q04887 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms