Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms