Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgfr4Q03142 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgfr4Q03142 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgfr4Q03142 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgfr4Q03142 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgfr4Q03142 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgfr4Q03142 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgfr4Q03142 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgfr4Q03142 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgfr4Q03142 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgfr4Q03142 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgfr4Q03142 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgfr4Q03142 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgfr4Q03142 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgfr4Q03142 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgfr4Q03142 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgfr4Q03142 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgfr4Q03142 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgfr4Q03142 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Fgfr4Q03142 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Fgfr4Q03142 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms