Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VcpQ01853 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VcpQ01853 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VcpQ01853 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VcpQ01853 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
VcpQ01853 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
VcpQ01853 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
VcpQ01853 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VcpQ01853 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VcpQ01853 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VcpQ01853 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VcpQ01853 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VcpQ01853 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VcpQ01853 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
VcpQ01853 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VcpQ01853 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VcpQ01853 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VcpQ01853 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
VcpQ01853 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VcpQ01853 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VcpQ01853 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VcpQ01853 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VcpQ01853 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VcpQ01853 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VcpQ01853 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VcpQ01853 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VcpQ01853 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VcpQ01853 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VcpQ01853 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VcpQ01853 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VcpQ01853 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VcpQ01853 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VcpQ01853 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VcpQ01853 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VcpQ01853 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VcpQ01853 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VcpQ01853 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VcpQ01853 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VcpQ01853 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VcpQ01853 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VcpQ01853 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VcpQ01853 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VcpQ01853 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VcpQ01853 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VcpQ01853 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VcpQ01853 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VcpQ01853 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms