Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms