Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms