Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec23aQ01405 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms