Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EgfrQ01279 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms