Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col1a2Q01149 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms