Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms