Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms