Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms