Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms