Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GabpaQ00422 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GabpaQ00422 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GabpaQ00422 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GabpaQ00422 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GabpaQ00422 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GabpaQ00422 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GabpaQ00422 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GabpaQ00422 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GabpaQ00422 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GabpaQ00422 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GabpaQ00422 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
GabpaQ00422 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GabpaQ00422 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GabpaQ00422 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GabpaQ00422 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GabpaQ00422 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GabpaQ00422 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GabpaQ00422 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GabpaQ00422 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GabpaQ00422 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GabpaQ00422 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms