Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Stx2Q00262 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stx2Q00262 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stx2Q00262 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stx2Q00262 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stx2Q00262 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stx2Q00262 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stx2Q00262 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stx2Q00262 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stx2Q00262 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stx2Q00262 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stx2Q00262 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx2Q00262 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx2Q00262 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx2Q00262 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx2Q00262 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx2Q00262 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx2Q00262 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx2Q00262 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx2Q00262 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx2Q00262 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx2Q00262 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx2Q00262 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx2Q00262 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx2Q00262 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms