Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cds1P98191 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cds1P98191 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cds1P98191 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cds1P98191 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cds1P98191 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cds1P98191 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cds1P98191 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cds1P98191 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cds1P98191 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cds1P98191 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms