Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brca2P97929 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brca2P97929 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brca2P97929 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brca2P97929 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brca2P97929 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brca2P97929 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brca2P97929 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brca2P97929 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brca2P97929 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brca2P97929 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brca2P97929 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brca2P97929 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Brca2P97929 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brca2P97929 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brca2P97929 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brca2P97929 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brca2P97929 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brca2P97929 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Brca2P97929 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brca2P97929 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brca2P97929 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brca2P97929 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brca2P97929 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brca2P97929 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brca2P97929 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brca2P97929 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brca2P97929 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brca2P97929 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Brca2P97929 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brca2P97929 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Brca2P97929 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Brca2P97929 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brca2P97929 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brca2P97929 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Brca2P97929 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brca2P97929 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brca2P97929 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brca2P97929 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brca2P97929 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms