Protein–RNA interactions for Protein: P97436

Nkx3-1, Homeobox protein Nkx-3.1, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx3-1P97436 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx3-1P97436 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx3-1P97436 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx3-1P97436 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx3-1P97436 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx3-1P97436 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx3-1P97436 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx3-1P97436 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx3-1P97436 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms