Protein–RNA interactions for Protein: P84228

Hist1h3b, Histone H3.2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist1h3bP84228 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hist1h3bP84228 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hist1h3bP84228 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hist1h3bP84228 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hist1h3bP84228 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hist1h3bP84228 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hist1h3bP84228 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hist1h3bP84228 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hist1h3bP84228 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hist1h3bP84228 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hist1h3bP84228 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hist1h3bP84228 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms