Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TgfbiP82198 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TgfbiP82198 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms