Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms