Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad50P70388 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad50P70388 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad50P70388 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad50P70388 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rad50P70388 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad50P70388 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad50P70388 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad50P70388 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms