Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vamp7P70280 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms