Protein–RNA interactions for Protein: P70271

Pdlim4, PDZ and LIM domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim4P70271 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdlim4P70271 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim4P70271 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms