Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NfixP70257 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfixP70257 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfixP70257 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NfixP70257 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfixP70257 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfixP70257 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NfixP70257 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfixP70257 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfixP70257 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfixP70257 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfixP70257 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfixP70257 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NfixP70257 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NfixP70257 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NfixP70257 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NfixP70257 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NfixP70257 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NfixP70257 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NfixP70257 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NfixP70257 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NfixP70257 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NfixP70257 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfixP70257 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfixP70257 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfixP70257 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfixP70257 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfixP70257 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfixP70257 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfixP70257 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfixP70257 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfixP70257 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfixP70257 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfixP70257 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfixP70257 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfixP70257 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfixP70257 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfixP70257 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfixP70257 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfixP70257 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfixP70257 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfixP70257 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfixP70257 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfixP70257 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfixP70257 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfixP70257 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfixP70257 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfixP70257 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfixP70257 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfixP70257 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfixP70257 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfixP70257 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfixP70257 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfixP70257 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfixP70257 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfixP70257 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfixP70257 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfixP70257 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NfixP70257 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NfixP70257 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfixP70257 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfixP70257 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfixP70257 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfixP70257 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfixP70257 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfixP70257 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfixP70257 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfixP70257 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfixP70257 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfixP70257 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfixP70257 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfixP70257 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfixP70257 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfixP70257 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfixP70257 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfixP70257 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfixP70257 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NfixP70257 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NfixP70257 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfixP70257 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfixP70257 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NfixP70257 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfixP70257 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfixP70257 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfixP70257 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NfixP70257 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfixP70257 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfixP70257 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfixP70257 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfixP70257 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfixP70257 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfixP70257 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfixP70257 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfixP70257 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NfixP70257 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfixP70257 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NfixP70257 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfixP70257 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfixP70257 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfixP70257 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms