Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf5P70191 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf5P70191 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf5P70191 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf5P70191 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf5P70191 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf5P70191 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf5P70191 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf5P70191 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf5P70191 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf5P70191 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms