Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtnP63089 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtnP63089 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtnP63089 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PtnP63089 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtnP63089 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtnP63089 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtnP63089 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtnP63089 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtnP63089 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtnP63089 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtnP63089 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtnP63089 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtnP63089 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtnP63089 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtnP63089 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtnP63089 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtnP63089 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtnP63089 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtnP63089 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtnP63089 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtnP63089 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtnP63089 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PtnP63089 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PtnP63089 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtnP63089 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PtnP63089 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtnP63089 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtnP63089 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtnP63089 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtnP63089 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtnP63089 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtnP63089 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtnP63089 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtnP63089 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtnP63089 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtnP63089 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtnP63089 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtnP63089 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtnP63089 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtnP63089 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtnP63089 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtnP63089 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PtnP63089 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PtnP63089 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtnP63089 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtnP63089 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtnP63089 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtnP63089 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtnP63089 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtnP63089 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtnP63089 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtnP63089 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtnP63089 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtnP63089 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtnP63089 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtnP63089 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtnP63089 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtnP63089 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtnP63089 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtnP63089 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtnP63089 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtnP63089 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtnP63089 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtnP63089 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtnP63089 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtnP63089 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtnP63089 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtnP63089 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtnP63089 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtnP63089 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtnP63089 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtnP63089 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtnP63089 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtnP63089 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtnP63089 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtnP63089 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtnP63089 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtnP63089 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtnP63089 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtnP63089 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtnP63089 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtnP63089 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtnP63089 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtnP63089 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtnP63089 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtnP63089 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtnP63089 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtnP63089 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtnP63089 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtnP63089 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtnP63089 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtnP63089 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtnP63089 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtnP63089 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtnP63089 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtnP63089 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtnP63089 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtnP63089 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtnP63089 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.4 ms