Protein–RNA interactions for Protein: P63011

Rab3a, Ras-related protein Rab-3A, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3aP63011 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3aP63011 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3aP63011 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3aP63011 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3aP63011 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3aP63011 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3aP63011 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3aP63011 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3aP63011 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3aP63011 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3aP63011 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3aP63011 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rab3aP63011 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3aP63011 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms