Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElobP62869 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElobP62869 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElobP62869 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElobP62869 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElobP62869 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElobP62869 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElobP62869 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElobP62869 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElobP62869 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElobP62869 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElobP62869 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElobP62869 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElobP62869 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ElobP62869 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElobP62869 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElobP62869 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElobP62869 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElobP62869 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElobP62869 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElobP62869 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElobP62869 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElobP62869 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElobP62869 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElobP62869 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElobP62869 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElobP62869 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElobP62869 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElobP62869 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElobP62869 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElobP62869 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElobP62869 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElobP62869 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElobP62869 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElobP62869 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElobP62869 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElobP62869 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElobP62869 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElobP62869 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElobP62869 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElobP62869 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ElobP62869 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ElobP62869 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ElobP62869 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ElobP62869 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ElobP62869 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ElobP62869 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ElobP62869 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ElobP62869 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ElobP62869 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ElobP62869 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ElobP62869 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ElobP62869 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ElobP62869 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ElobP62869 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ElobP62869 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ElobP62869 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ElobP62869 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ElobP62869 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ElobP62869 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ElobP62869 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ElobP62869 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ElobP62869 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ElobP62869 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ElobP62869 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ElobP62869 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ElobP62869 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ElobP62869 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ElobP62869 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ElobP62869 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ElobP62869 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ElobP62869 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ElobP62869 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ElobP62869 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ElobP62869 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ElobP62869 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ElobP62869 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ElobP62869 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ElobP62869 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ElobP62869 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ElobP62869 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ElobP62869 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ElobP62869 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ElobP62869 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ElobP62869 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ElobP62869 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ElobP62869 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ElobP62869 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ElobP62869 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ElobP62869 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ElobP62869 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ElobP62869 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ElobP62869 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ElobP62869 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ElobP62869 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ElobP62869 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ElobP62869 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ElobP62869 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ElobP62869 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ElobP62869 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms