Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms