Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copz1P61924 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copz1P61924 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copz1P61924 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copz1P61924 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Copz1P61924 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copz1P61924 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copz1P61924 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms