Protein–RNA interactions for Protein: P61750

Arf4, ADP-ribosylation factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf4P61750 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Arf4P61750 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Arf4P61750 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arf4P61750 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arf4P61750 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arf4P61750 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arf4P61750 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arf4P61750 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Arf4P61750 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arf4P61750 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arf4P61750 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arf4P61750 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arf4P61750 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Arf4P61750 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arf4P61750 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arf4P61750 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arf4P61750 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arf4P61750 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arf4P61750 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arf4P61750 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arf4P61750 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arf4P61750 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arf4P61750 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arf4P61750 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arf4P61750 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arf4P61750 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Arf4P61750 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arf4P61750 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Arf4P61750 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Arf4P61750 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Arf4P61750 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arf4P61750 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arf4P61750 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arf4P61750 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arf4P61750 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms