Protein–RNA interactions for Protein: P61588

Rnd3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnd3P61588 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms