Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2d1P61080 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2d1P61080 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2d1P61080 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2d1P61080 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2d1P61080 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2d1P61080 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2d1P61080 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2d1P61080 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2d1P61080 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2d1P61080 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2d1P61080 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2d1P61080 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2d1P61080 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2d1P61080 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2d1P61080 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2d1P61080 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2d1P61080 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2d1P61080 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2d1P61080 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2d1P61080 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2d1P61080 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2d1P61080 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2d1P61080 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2d1P61080 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2d1P61080 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2d1P61080 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2d1P61080 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2d1P61080 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms