Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms