Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Strn4P58404 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Strn4P58404 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Strn4P58404 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Strn4P58404 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Strn4P58404 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Strn4P58404 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Strn4P58404 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Strn4P58404 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Strn4P58404 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Strn4P58404 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms