Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpaP58389 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpaP58389 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpaP58389 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpaP58389 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PtpaP58389 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpaP58389 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpaP58389 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpaP58389 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpaP58389 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpaP58389 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpaP58389 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpaP58389 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpaP58389 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpaP58389 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpaP58389 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpaP58389 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpaP58389 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpaP58389 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpaP58389 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpaP58389 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpaP58389 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpaP58389 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpaP58389 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpaP58389 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpaP58389 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtpaP58389 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpaP58389 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpaP58389 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpaP58389 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpaP58389 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpaP58389 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpaP58389 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpaP58389 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpaP58389 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpaP58389 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpaP58389 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtpaP58389 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtpaP58389 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtpaP58389 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms