Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms