Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CdaP56389 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CdaP56389 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CdaP56389 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CdaP56389 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CdaP56389 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CdaP56389 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CdaP56389 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CdaP56389 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CdaP56389 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CdaP56389 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CdaP56389 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CdaP56389 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CdaP56389 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CdaP56389 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CdaP56389 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CdaP56389 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CdaP56389 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CdaP56389 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CdaP56389 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CdaP56389 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CdaP56389 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CdaP56389 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CdaP56389 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CdaP56389 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CdaP56389 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CdaP56389 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CdaP56389 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CdaP56389 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CdaP56389 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CdaP56389 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CdaP56389 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CdaP56389 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CdaP56389 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CdaP56389 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CdaP56389 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CdaP56389 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CdaP56389 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CdaP56389 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CdaP56389 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CdaP56389 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CdaP56389 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CdaP56389 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CdaP56389 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CdaP56389 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CdaP56389 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CdaP56389 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CdaP56389 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CdaP56389 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CdaP56389 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CdaP56389 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CdaP56389 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CdaP56389 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CdaP56389 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CdaP56389 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CdaP56389 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CdaP56389 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CdaP56389 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CdaP56389 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CdaP56389 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CdaP56389 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CdaP56389 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CdaP56389 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CdaP56389 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CdaP56389 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CdaP56389 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CdaP56389 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CdaP56389 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CdaP56389 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CdaP56389 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CdaP56389 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CdaP56389 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CdaP56389 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CdaP56389 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CdaP56389 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CdaP56389 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CdaP56389 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CdaP56389 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CdaP56389 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CdaP56389 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CdaP56389 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CdaP56389 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CdaP56389 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CdaP56389 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CdaP56389 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CdaP56389 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CdaP56389 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CdaP56389 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CdaP56389 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CdaP56389 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CdaP56389 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CdaP56389 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CdaP56389 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CdaP56389 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CdaP56389 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CdaP56389 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CdaP56389 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CdaP56389 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CdaP56389 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CdaP56389 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms