Protein–RNA interactions for Protein: P55292

Dsc2, Desmocollin-2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsc2P55292 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Dsc2P55292 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsc2P55292 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsc2P55292 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsc2P55292 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsc2P55292 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsc2P55292 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsc2P55292 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsc2P55292 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsc2P55292 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsc2P55292 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsc2P55292 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsc2P55292 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsc2P55292 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsc2P55292 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsc2P55292 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsc2P55292 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsc2P55292 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsc2P55292 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsc2P55292 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsc2P55292 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsc2P55292 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsc2P55292 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsc2P55292 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsc2P55292 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsc2P55292 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsc2P55292 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsc2P55292 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsc2P55292 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsc2P55292 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsc2P55292 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsc2P55292 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsc2P55292 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsc2P55292 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsc2P55292 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsc2P55292 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsc2P55292 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms