Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcd3P55096 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms