Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Faf1P54731 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Faf1P54731 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Faf1P54731 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Faf1P54731 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Faf1P54731 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Faf1P54731 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Faf1P54731 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms