Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms